雜交作物的種子。水稻、棉花、大白菜、洋蔥、番茄、茄子、辣椒、胡蘿卜、黃瓜和西瓜等一代雜交種具有雙親的綜合優勢，適應性宜留作種用，因為雜交種從第2代開始，便產生性狀分離現象，生長不一致，雜交優勢減退，產量降低，因此生產上雜交種子隻能用一年，不能繼續留種。

在水泥場上曬過的種子。在水泥地上曬種，特別是含水量高的棉種或稻種，由於地麵溫度高，種子呼吸作用旺盛，體現人生理機能受到破壞，部分種子會變成“啞種子”(即種胚受熱致死)，完全失去發芽能力。

噴過乙烯利的作物的種子。乙烯利是一植物生長調節劑，容易被植物吸收，進入到植物的莖、葉、花、果細胞中。進入植物細胞後，經分解，逐漸釋放也乙烯，對植物具有生長、發育和代謝生產調節作用，使作物增產、增收。但是用噴過乙烯利的作物種子做種，例如：乙烯利催熟處理過的辣椒、番茄、西瓜和甜瓜等種子，則是有害無益的。這是因為用乙烯利催熟縮短了農作物的自然成熟期，造成種胚發育不全，會嚴重影響種子發芽率。

與農藥化肥一同存放的種子。有的農戶習慣將種子與農藥化肥存放在一起，由於農藥與化肥均會散發有毒有害氣體，破壞種子正常的生理機能，會大大減弱種子的發芽能力，影響出苗率。